硝态氮在体内还原呈铵态氮后，才能被吸收利用；而氨态氮也就是铵态氮,可直接光合作用产物有机酸结合,形成氨基酸,进而形成其它含氮有机物。

除此之外，硝态氮与氨态氮在反应速度、不同作物需求、分布方式、作物吸收利用以及对土壤的ph值影响等方面都有所区别。

反应速度。硝态氮的化学成分比较活跃，使用后见效快，而氨态氮见效相对要慢一些。

不同作物需求。栽培在水淹环境中的水生作物吸收的氮源主要为还原态的氨态氮，生长在旱地的旱作物，则见多利用氧化态的硝态氮。

分布方式。较小的土粒一般呈负电性，能吸持铵态氮，所以氨态氮施用后在土壤中移动范围小，多年使用氨态氮会使氮肥集中在上层土壤累积；硝态氮因为呈负电性，土粒难以吸附，在土壤中移动范围较大，在不同土壤层分布相对均匀。

作物吸收利用。作物吸入体内的硝态氮可还原为铵态氮，硝态氮也可直接被作物叶片等器官储存，而氨态氮被作物吸入，在作物体内不能存储，大量使用后会引起叶片的斑点、黄化等氨中毒。

ph值。长期使用硫酸氨等氨态氮为主的生理酸性肥料，会引起土壤酸化，适量使用硝态氮可有所改善。