1、外形不同：墨鱼的体型为椭圆形，外表呈墨色，10条腕足中有两条尤其发达，且吸盘为四行，较发达的两条腕足上，只有顶端才有吸盘；章鱼的体型则较为圆润，类似于椭圆形，有8条腕足。

2、结构不同：墨鱼体内有一块长长的硬质“骨头”，叫做海螵蛸；章鱼体内则没有“骨头”，身体柔软。

3、分布不同：墨鱼分布于热带及温带浅水中，冬季时会向深海迁徙；章鱼则分布于热带及温带海域。