1.灭菌程度。灭菌程度是一次性口罩灭菌与非灭菌的区别之一，虽然两者都是在无菌车间生产的，但是灭菌型口罩的灭菌程度和标准会远远大于非灭菌型，且生产灭菌口罩车间的无菌级别会高于非灭菌型。

2.微生物指标。一次性灭菌型口罩和非灭菌型口罩都属于一次性医用口罩，都是按照YY/T 0969的规定生产的，但是两者对口罩的微生物指标也有所不同，灭菌型口罩要求无菌，而非灭菌型口罩只是对微生物有限度要求。

3.防护作用不同。非灭菌口罩就是普通的防尘口罩，一般是不能有效的帮助隔离细菌、病毒的，只适用于一般的雾霾天，防尘防风。无菌口罩经过消毒后可以杀灭或清除病原微生物，使其达到无害化；因呼吸阻力小，滤料吸附力强，能有效隔绝污染源。

4.医用口罩由口罩面体和拉紧带组成，其中口罩面体分为内、中、外三层，普通医用口罩就是人们常见的纱布口罩，有四层、八层、十六层等规格。

非无菌口罩在工厂车间使用的比较多，平时遇到雾霾天或大风天气，也可以佩戴这种口罩进行防护，而灭菌口罩多在医院使用。