1、原料不同：

龟甲胶是由乌龟腹部的腹甲经煎熬、浓缩制成的固体胶；阿胶，又名驴皮胶，是由驴皮去毛后熬成的胶状物。

2、颜色不同：

龟甲胶一般是长方形或方形的扁块，颜色一般是深褐色，胶质很硬而且很脆，掰开来看的话断面会比较整齐光亮，对光照视时呈透明状，气味带有微小腥味，不过腥味很淡；正常阿胶的颜色为琥珀色，胶体一般是透明，闻的时候没有臭味。

3、制作方法不同：

龟甲胶的制作方法是捕捉龟后杀死剥取背甲及腹甲，除去残肉，取漂泡后的净龟甲进行水煎、滤过、滤液合并后文火熬煮至稠膏状，冷凝制作而成；阿胶是将驴皮去毛后熬成胶后，再放阿井水熬煮而成的。

4、食用方法不同：

龟甲胶可以作为入汤剂熬汤食用，也可以用开水或者黄酒混合后进行口服食用；阿胶一般只用开水或者是黄酒溶化后口服，不进行熬汤食用。