女生叫男生憨憨没有什么特别的寓意，这只是一种表示关系亲近的昵称，带有一点嗔怪的意思，可能女生觉得男生比较耿直，或者比较憨厚腼腆。“憨憨”一词原本是某些地区的方言，由于网络普及范围越来越广，所以逐渐被网友所熟知，进而演变为网络流行语，其本意就是用来调侃别人笨笨的、憨憨的行为。