1、细胞大小。原核细胞比真核细胞小。

2、细胞结构。原核生物的细胞壁不含纤维素，细胞器只有核糖体，细胞核无核膜（主要特点）、有拟核。真核生物的细胞壁不只含有纤维素，细胞核完整。

3、细胞增殖方式。原核生物是无性生殖，例如蓝藻、细菌等。真核生物是有性生殖和无性生殖，例如衣澡、真菌、动物等。