消灭店里小飞虫的窍门是：1、花露水加酒精消灭法；2、保持干净的卫生；3、小苏打法；4、喷洒杀虫剂。

1、花露水加酒精消灭法：将花露水和酒精倒入喷壶中，再加少许清水混合，然后在有小飞虫的地方喷洒即可。

2、保持干净的卫生：店里要时刻保持干净，垃圾桶内的垃圾要及时清理。

3、小苏打法：准备一个喷壶，喷壶中倒入小苏打、洗洁精、白砂糖、水，然后混合均匀，喷洒在有小飞虫的地方即可。

4、喷洒杀虫剂：在店里没有客人的时候，将店里的门窗关好，然后喷洒杀虫剂，在第二天营业的时候将门窗打开通风，所有餐具清洗一遍即可。