柯南现在还未播完，所以黑色组织出场集数还不能确定，但是黑色组织在1、13、54、28、29、176、177、178、230、231、271、272、286、287……等集都有出现。

柯南中的黑色组织是什么？

是在《名侦探柯南》中一个笼罩在神秘色彩中的跨国犯罪组织，工藤新一一开始就是被该组织的成员下药导致身体缩小，整个故事的开始和这个黑色组织有很亲密的关系。

柯南中的黑色组织幕后黑手是谁？

柯南一直都在不断的更新，但是对于这个黑色组织的幕后黑手却还没有被发现，大家都觉得可能会到最终结局才会出现吧，但是根据剧情，大家进行了大胆猜测。

目暮警官：不少事件都有目暮警官在场，而且常常草草了事，胡乱得出结论，小五郎每次胡乱猜测，目暮警官都很附和。

工藤优作：这是新一的父亲，很有可能是为了让他体验各种人生而让他变小，等到新一足够强大，说不定会掌控黑衣组织。

阿笠博士：很多人都怀疑阿笠博士，因为他本身就很奇怪，明明能发明出各种各样实用的道具，却不投放市场，这么强大的头脑，却仍然没有豪华的住宅，没有得到国家重用。

毛利小五郎：有时候大家觉得小五郎好像有很强的推理能力，但是总表现出很傻的样子，这可能是为了让人放松对自己的注意而故意装出来的。而且枪法、格斗技都堪称一流，很有可能是黑衣组织的人。