这部电视剧讲述了仁华医院副院长武明训即将接任院长。趁去美国出差拜访老同学美东著名的心脏外科医生钟立行，正遇上钟立行的妹妹车祸死亡。钟立行不能接受身为医生却无法救活妹妹的残酷现实而心理崩溃，武明训借机将钟立行带回国，请他回仁华医院建立心脏外科的声誉，增加他就任院长的砝码。不料钟立行的到来却在医院引起一连串的震动----他精湛的医术，专业的作风，对医生职业清教徒般的虔诚让全院上下无不为之吸引，也在武明训的妻子，麻醉科主任江一丹心中激起涟漪。医院接二连三出事，是管理疏忽，是技术失误，还是无力回天的医学局限？武明训与钟立行产生严重分歧。一群充满理想与献身精神的医生在理想与现实中艰难跋涉，最终找回希波克拉底誓言给予的崇高与责任和 “医者仁心”的职业信仰。

医者仁心是国内第一部全景式反映医生职业生活的医疗剧，不回避医患矛盾，医者在理想与现实中的挣扎深深触动了观众内心，他们奋力救助生命的情景更让人为之动容。在医患矛盾尖锐的时代背景下，医生对理想和信仰的那份执着，同时呼唤知识分子内心的良知，重塑医疗行业的职业道德和信仰，解答了社会和公众对卫生行业的一些疑问，对目前比较突出的医患矛盾做了全面系统的形象展示和分析，呼唤全社会诚信与理性，传达正确职业操守和道德及诚信价值观，弘扬了医者仁心的主旋律。