国子监来了个女弟子叙述的是大司马桑公的独女桑祈为了完成赌约，决定进到国子监，和青梅竹马的朋友卓文远等少年公子们变成了同窗，也变成国子监史上唯一的1个女弟子的故事。大司马桑公的独女桑祈被别人挖坑应下了1个赌约，要让大燕第1公子晏云之收下自己的荷包，而且同意上元节赏花灯之邀。本以为轻松就能完成，岂料困难重重。

获知晏云之在国子监讲课，她费尽心机进到国子监接近他，在2人纠缠共处的过程中，逐渐萌发了情意。此外，京城的和平局势因一秘密组织而破坏，为了查到背后主谋，桑祈与晏云之联合调查，誓要惩奸除恶。在经历了1场恶斗后，真相大白，2人也功成身退，重归国子监，迎天下学子，成一世佳传。