新鲜的羊肚菌要用清水多清洗几遍，直到将羊肚菌里面的泥沙清除掉。在清洗过程中，可以顺着同一个方向轻轻地搅拌、打圈，这样便可将羊肚菌表面孔内的脏物都清洗出来。

新鲜的羊肚菌不需要进行泡发，只要取一些适量的清水，将羊肚菌放进水里快速打圈并进行清洗，反复2~3次即可。羊肚菌是一种珍贵的食用菌品种，因其菌盖表面凹凸不平、状如羊肚而得名，在食用之前，必须清洗干净才可以。

清洗新鲜的羊肚菌时，不要使用开水，也不能用凉水，应该使用45~50度的温水，这种温度既可以使羊肚菌里面的香味散发出来，同时又不会破坏羊肚菌的口感。新鲜的羊肚菌没有必要浸泡，只有干的羊肚菌才需要泡发。

羊肚菌一般生长在树林中，其中含有大量的碳水化合物以及水分，很容易滋生细菌而导致腐烂，所以保存的时间比较短。如果羊肚菌的量不是很多，建议在短期内就吃完，若羊肚菌的量比较多，可以将羊肚菌摊放在阴凉干燥处保存，注意避免潮湿、避免阳光直射。