1、形状不同：

目鱼的体形是侧扁，形状为舌状，身体里面有一个梭状骨，一般体长25-40厘米、体重500-1500克，头部很短；墨鱼的体形是比较宽短的，肚子是圆的，是海洋软体动物，所以没有骨头，通常形状为盾形，头部很发达。

2、眼部不同：

目鱼的眼睛比较小，两只眼睛都分布在头的左侧，一般在口的下面；墨鱼的眼睛比较大，两只眼睛分布在头的两侧。

3、颜色不同：

目鱼的身体颜色是白里透红的；而墨鱼的身体在没有清洗的时候会包裹着一层黏液，清洗过后，就会发现墨鱼身上的颜色非常白，而且连骨头都是白色的。

4、分布地区不同：

目鱼分布在朝鲜、日本、中国，在中国分布在渤海、黄海、东海、南海；墨鱼在高盐温暖的海洋里面生活，近海、远洋，水层、海底都有分布，大多分布在我国沿海地区。