镇魂大结局是沈巍在夜尊体内自爆，两人同归于尽。赵云澜化身镇魂灯灯芯，永世沉沦烈焰焚身。老李为阻拦鸦族进入特调处，被黑能量击穿心肺而死。桑赞汪徵两只后勤鬼，为替赵云澜阻挡夜尊的攻击而死。祝红成为亚兽族大族长，獐狮遵守与赵云澜的约定，接管赵云澜的身体，替他保卫龙城。林静回到特调处。

万年后，地球除人类以外的各类变异物种频现，地球生物本性中的欲望、贪婪、怨恨也在迅猛地扩张。变异者们开始不满足于共存的现状，都认为自己是进化的人类，是上天赋予了自己力量。在一场人类和变异者之间的战争中变异者落败，被赶入“地界”，这群变异人有了他们新的名字——地界人。战争后，赵云澜为救沈巍长久昏睡，沈巍信守着对赵云澜的承诺，成为地界看守者。人类成立特别调查处 ，负责抓住从“地界”逃窜到人类世界的地界人，并将其送回“地界”。由于机构的特殊、神秘，甚少为人知晓，人界与地界就此相安无事。亿万年之后，特别调查处慢慢失去了人们的关注，大家也逐渐遗忘了地下还有一群特殊”人类”的存在，特别调查处成了一群怪咖的聚集地。

特别调查处的处长竟然是苏醒后的赵云澜，但此刻的他对自己的前尘往事一无所知。一连串地界人引发的诡异事件之后，特别调查处成员发现沈巍表面是一个普通教授，实则有着另一个神秘的身份，这一切似乎都与“四圣器”有着千丝万缕的关系。当四圣器聚集在一起时能产生最强大的能量，地界人若想掀翻地下监狱，四圣器就是他们力量的依托。赵云澜苏醒的原因，昔日沈巍被驱逐出去的黑暗基因，也与这一切阴谋，有着神秘的联系。